El Capellán del Colegio Mayor es D. Francisco José Marín Porgueres, sacerdote de la Prelatura del Opus Dei. Es Doctor en Teología Moral y profesor de Antropología y Ética en la Escuela de Ingenieros de Tecnun.

Con el servicio de Capellanía se ofrece a los colegiales la posibilidad de tener una atención espiritual cristiana si lo desean. De igual modo, a lo largo del curso tienen lugar distintas celebraciones litúrgicas, entre las que destaca la Santa Misa, que se celebra a diario. También hay meditaciones de los sábados por la tarde y se organiza una Vela al Santísimo los primeros viernes de mes.

Por lo demás, para aquellos colegiales que quieran profundizar en su formación espiritual, se organizaron cursos de retiro espiritual de fin de semana, así como retiros más breves, de unas horas, con periodicidad mensual.

Durante el mes de mayo es habitual que se organicen romerías a santuarios y ermitas tales como Itziar o Guadalupe. También viene participando tradicionalmente en eventos como la romería universitaria de Torreciudad, la marcha a Arantzazu, o la peregrinación organizada por la Hospitalidad de Lourdes.